2021年度

論文発表

1.	Immunological features that associate with the strength of antibody responses to BNT162b2 mRNA vaccine against SARS-CoV-2. Kageyama T, Tanaka S, Etori K, Hattori K, Miyachi K, Kasuya T, Iwamoto T, Ikeda K, Igari H, Yokote K, Nakajima H. Vaccine. 2022 Mar 25;40(14):2129-2133. doi: 10.1016/j.vaccine.2022.02.045.
2.	Escaping stochastic extinction of mutant virus: Temporal pattern of emergence of drug resistance within a host. Hayashi R, Iwami S, Iwasa Y. J Theor Biol. 2022 Mar 21;537:111029. doi: 10.1016/j.jtbi.2022.111029.
3.	Establishment of a stable SARS-CoV-2 replicon system for application in high-throughput screening. Tanaka T, Saito A, Suzuki T, Miyamoto Y, Takayama K, Okamoto T, Moriishi K. Antiviral Res. 2022 Mar;199:105268. doi: 10.1016/j.antiviral.2022.105268.
4.	Evaluating the cost-effectiveness of a pre-exposure prophylaxis program for HIV prevention for men who have sex with men in Japan. Yamamoto N, Koizumi Y, Tsuzuki S, Ejima K, Takano M, Iwami S, Mizushima D, Oka S. Sci Rep. 2022 Feb 23;12(1):3088. doi: 10.1038/s41598-022-07116-4.
5.	TANK prevents IFN-dependent fatal diffuse alveolar hemorrhage by suppressing DNA-cGAS aggregation. Wakabayashi A, Yoshinaga M, Takeuchi O. Life Sci Alliance. 2021 Nov 24;5(2):e202101067. doi: 10.26508/lsa.202101067.
6.	Ultrasensitive detection of SARS-CoV-2 nucleocapsid protein using large gold nanoparticle-enhanced surface plasmon resonance. Yano TA, Kajisa T, Ono M, Miyasaka Y, Hasegawa Y, Saito A, Otsuka K, Sakane A, Sasaki T, Yasutomo K, Hamajima R, Kanai Y, Kobayashi T, Matsuura Y, Itonaga M, Yasui T. Sci Rep. 2022 Jan 20;12(1):1060. doi: 10.1038/s41598-022-05036-x.
7.	Structural basis of membrane recognition of Toxoplasma gondii vacuole by Irgb6. Saijo-Hamano Y, Sherif AA, Pradipta A, Sasai M, Sakai N, Sakihama Y, Yamamoto M, Standley DM, Nitta R. Life Sci Alliance. 2021 Nov 9;5(1):e202101149. doi: 10.26508/lsa.202101149.
8.	A widely distributed HIV-1 provirus elimination assay to evaluate latency-reversing agents in vitro. Matsuda K, Islam S, Takada T, Tsuchiya K, Yang Tan BJ, Hattori SI, Katsuya H, Kitagawa K, Kim KS, Matsuo M, Sugata K, Delino NS, Gatanaga H, Yoshimura K, Matsushita S, Mitsuya H, Iwami S, Satou Y, Maeda K. Cell Rep Methods. 2021 Nov 29;1(8):100122. doi: 10.1016/j.crmeth.2021.100122.
9.	Antibody responses to BNT162b2 mRNA COVID-19 vaccine and their predictors among healthcare workers in a tertiary referral hospital in Japan. Kageyama T, Ikeda K, Tanaka S, Taniguchi T, Igari H, Onouchi Y, Kaneda A, Matsushita K, Hanaoka H, Nakada TA, Ohtori S, Yoshino I, Matsubara H, Nakayama T, Yokote K, Nakajima H. Clin Microbiol Infect. 2021 Dec;27(12):1861.e1-1861.e5. doi: 10.1016/j.cmi.2021.07.042.
10.	Air-liquid interphase culture confers SARS-CoV-2 susceptibility to A549 alveolar epithelial cells. Sasaki M, Kishimoto M, Itakura Y, Tabata K, Intaruck K, Uemura K, Toba S, Sanaki T, Sato A, Hall WW, Orba Y, Sawa H. Biochem Biophys Res Commun. 2021 Nov 5;577:146-151. doi: 10.1016/j.bbrc.2021.09.015. Epub 2021 Sep 10.
11.	Inhibitory effect of a novel thiazolidinedione derivative on hepatitis B virus entry. Tanaka T, Okuyama-Dobashi K, Motohashi R, Yokoe H, Takahashi K, Wiriyasermkul P, Kasai H, Yamashita A, Maekawa S, Enomoto N, Ryo A, Nagamori S, Tsubuki M, Moriishi K. Antiviral Res. 2021 Oct;194:105165. doi: 10.1016/j.antiviral.2021.105165.
12.	Incomplete antiviral treatment may induce longer durations of viral shedding during SARS-CoV-2 infection. Kim KS, Iwanami S, Oda T, Fujita Y, Kuba K, Miyazaki T, Ejima K, Iwami S. Life Sci Alliance. 2021 Aug 3;4(10):e202101049. doi: 10.26508/lsa.202101049. Print 2021 Oct.
13.	A mixture-of-experts deep generative model for integrated analysis of single-cell multiomics data. Minoura K, Abe K, Nam H, Nishikawa H, Shimamura T. Cell Rep Methods. 2021 Sep 15;1(5):100071. doi: 10.1016/j.crmeth.2021.100071.
14.	A novel nairovirus associated with acute febrile illness in Hokkaido, Japan. Kodama F, Yamaguchi H, Park E, Tatemoto K, Sashika M, Nakao R, Terauchi Y, Mizuma K, Orba Y, Kariwa H, Hagiwara K, Okazaki K, Goto A, Komagome R, Miyoshi M, Ito T, Yamano K, Yoshii K, Funaki C, Ishizuka M, Shigeno A, Itakura Y, Bell-Sakyi L, Edagawa S, Nagasaka A, Sakoda Y, Sawa H, Maeda K, Saijo M, Matsuno K. Nat Commun. 2021 Sep 20;12(1):5539. doi: 10.1038/s41467-021-25857-0.
15.	SARS-CoV-2 Bearing a Mutation at the S1/S2 Cleavage Site Exhibits Attenuated Virulence and Confers Protective Immunity. Sasaki M, Toba S, Itakura Y, Chambaro HM, Kishimoto M, Tabata K, Intaruck K, Uemura K, Sanaki T, Sato A, Hall WW, Orba Y, Sawa H. mBio. 2021 Aug 31;12(4):e0141521. doi: 10.1128/mBio.01415-21.
16.	Revisiting the guidelines for ending isolation for COVID-19 patients. Jeong YD, Ejima K, Kim KS, Iwanami S, Bento AI, Fujita Y, Jung IH, Aihara K, Watashi K, Miyazaki T, Wakita T, Iwami S, Ajelli M. Elife. 2021 Jul 27;10:e69340. doi: 10.7554/eLife.69340.
17.	Detection of significant antiviral drug effects on COVID-19 with reasonable sample sizes in randomized controlled trials: A modeling study. Iwanami S, Ejima K, Kim KS, Noshita K, Fujita Y, Miyazaki T, Kohno S, Miyazaki Y, Morimoto S, Nakaoka S, Koizumi Y, Asai Y, Aihara K, Watashi K, Thompson RN, Shibuya K, Fujiu K, Perelson AS, Iwami S, Wakita T. PLoS Med. 2021 Jul 6;18(7):e1003660. doi: 10.1371/journal.pmed.1003660.
18.	An infectivity-enhancing site on the SARS-CoV-2 spike protein targeted by antibodies. Liu Y, Soh WT, Kishikawa JI, Hirose M, Nakayama EE, Li S, Sasai M, Suzuki T, Tada A, Arakawa A, Matsuoka S, Akamatsu K, Matsuda M, Ono C, Torii S, Kishida K, Jin H, Nakai W, Arase N, Nakagawa A, Matsumoto M, Nakazaki Y, Shindo Y, Kohyama M, Tomii K, Ohmura K, Ohshima S, Okamoto T, Yamamoto M, Nakagami H, Matsuura Y, Nakagawa A, Kato T, Okada M, Standley DM, Shioda T, Arase H. Cell. 2021 Jun 24;184(13):3452-3466.e18. doi: 10.1016/j.cell.2021.05.032.
19.	Effect of Reduced-Dose vs High-Dose Glucocorticoids Added to Rituximab on Remission Induction in ANCA-Associated Vasculitis: A Randomized Clinical Trial. Furuta S, Nakagomi D, Kobayashi Y, Hiraguri M, Sugiyama T, Amano K, Umibe T, Kono H, Kurasawa K, Kita Y, Matsumura R, Kaneko Y, Ninagawa K, Hiromura K, Kagami SI, Inaba Y, Hanaoka H, Ikeda K, Nakajima H; LoVAS Collaborators. JAMA. 2021 Jun 1;325(21):2178-2187. doi: 10.1001/jama.2021.6615.
20.	Estimation of the incubation period of COVID-19 using viral load data. Ejima K, Kim KS, Ludema C, Bento AI, Iwanami S, Fujita Y, Ohashi H, Koizumi Y, Watashi K, Aihara K, Nishiura H, Iwami S. Epidemics. 2021 Jun;35:100454. doi: 10.1016/j.epidem.2021.100454.
21.	HIV Testing by Public Health Centers and Municipalities and New HIV Cases During the COVID-19 Pandemic in Japan. Ejima K, Koizumi Y, Yamamoto N, Rosenberg M, Ludema C, Bento AI, Yoneoka D, Ichikawa S, Mizushima D, Iwami S. J Acquir Immune Defic Syndr. 2021 Jun 1;87(2):e182-e187. doi: 10.1097/QAI.0000000000002660.
22.	JRAB/MICAL-L2 undergoes liquid-liquid phase separation to form tubular recycling endosomes. Sakane A, Yano TA, Uchihashi T, Horikawa K, Hara Y, Imoto I, Kurisu S, Yamada H, Takei K, Sasaki T. Commun Biol. 2021 May 11;4(1):551. doi: 10.1038/s42003-021-02080-7.
23.	Mefloquine, a Potent Anti-severe Acute Respiratory Syndrome-Related Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Drug as an Entry Inhibitor in vitro. Shionoya K, Yamasaki M, Iwanami S, Ito Y, Fukushi S, Ohashi H, Saso W, Tanaka T, Aoki S, Kuramochi K, Iwami S, Takahashi Y, Suzuki T, Muramatsu M, Takeda M, Wakita T, Watashi K. Front Microbiol. 2021 Apr 30;12:651403. doi: 10.3389/fmicb.2021.651403.
24.	Efficacy and safety of nelfinavir in asymptomatic and mild COVID-19 patients: a structured summary of a study protocol for a multicenter, randomized controlled trial. Hosogaya N, Miyazaki T, Fukushige Y, Takemori S, Morimoto S, Yamamoto H, Hori M, Kurokawa T, Kawasaki Y, Hanawa M, Fujii Y, Hanaoka H, Iwami S, Watashi K, Yamagoe S, Miyazaki Y, Wakita T, Izumikawa K, Yanagihara K, Mukae H, Kohno S; Nelfinavir Study Group. Trials. 2021 Apr 28;22(1):309. doi: 10.1186/s13063-021-05282-w.
25.	Potential anti-COVID-19 agents, cepharanthine and nelfinavir, and their usage for combination treatment. Ohashi H, Watashi K, Saso W, Shionoya K, Iwanami S, Hirokawa T, Shirai T, Kanaya S, Ito Y, Kim KS, Nomura T, Suzuki T, Nishioka K, Ando S, Ejima K, Koizumi Y, Tanaka T, Aoki S, Kuramochi K, Suzuki T, Hashiguchi T, Maenaka K, Matano T, Muramatsu M, Saijo M, Aihara K, Iwami S, Takeda M, McKeating JA, Wakita T. iScience. 2021 Apr 23;24(4):102367. doi: 10.1016/j.isci.2021.102367.
26.	Establishment of a reverse genetics system for SARS-CoV-2 using circular polymerase extension reaction. Torii S, Ono C, Suzuki R, Morioka Y, Anzai I, Fauzyah Y, Maeda Y, Kamitani W, Fukuhara T, Matsuura Y. Cell Rep. 2021 Apr 20;35(3):109014. doi: 10.1016/j.celrep.2021.109014.
27.	Time variation in the probability of failing to detect a case of polymerase chain reaction testing for SARS-CoV-2 as estimated from a viral dynamics model. Ejima K, Kim KS, Iwanami S, Fujita Y, Li M, Zoh RS, Aihara K, Miyazaki T, Wakita T, Iwami S. J R Soc Interface. 2021 Apr;18(177):20200947. doi: 10.1098/rsif.2020.0947.
28.	Plat-E: an efficient and stable system for transient packaging of retroviruses. Morita S, Kojima T, Kitamura T. Gene Ther. 2000 Jun;7(12):1063-6. doi: 10.1038/sj.gt.3301206.

招待講演

発表者名	タイトル	学会名	年月
森石恆司	B型およびC型肝炎ウイルスの感染培養細胞系の開発	令和3年度「感染・免疫・がん・炎症」　全国共同研究拠点シンポジウム	2022年3月
岡田峰陽	痒みと神経：感覚神経のIL-31受容体とSTAT3の役割	第25回日本獣医皮膚科学会学術大会・総会	2022年3月
岡田峰陽	アトピー性皮膚炎のかゆみ	日本アレルギー学会第8回総合アレルギー講習会	2022年3月
川上英良	予防・先制医療に向けたデータ駆動型アプローチ	第92回日本衛生学会学術総会	2022年3月
森石恆司	Establishment of a Cell Culture Model Permissive for Infection by Hepatitis B and C Viruses	United States – Japan Cooperative Medical Sciences Program	2022年3月
鈴木　穣	Intensive Single Cell Analysis Reveals Immune Cell Diversity among Healthy Individuals	第95回日本薬理学会年会	2022年3月
岡田峰陽	IL-31刺激を受けた感覚神経による痒み誘導と炎症制御	第95回日本薬理学会学会年会	2022年3月
澤新一郎	病原性微生物感染動物からの細胞単離とシングルセルRNAシークエンスの実際	ナノスティングス学会	2022年2月
松浦　善治	新型コロナウイルスの性状とその制御法	大阪大学先導的学際研究機構創薬サイエンス部門シンポジウム	2022年2月
川上英良	医療分野における人工知能研究の実際	第32回日本疫学会学術総会	2022年1月
島村徹平	データから読み解く生命医科学	脳神経内科医のためのバイオインフォマティクス・ハンズオン 2021	2022年1月
岡田康志	Live cell imaging technologies for single-cell analysis – How can imaging meets genomics?	Pacifichem 2021	2021年12月
山本雅裕	Role of PLCbeta4 in CD8+ T cell signaling	The 2nd ImmunoSensation2 IFReC Joint Workshop	2021年12月
川上英良	データ駆動型アプローチによる疾患の層別化と予測	理化学研究所・熊本大学合同生命科学領域DXシンポジウム	2021年12月
Koji Hase	Maternal gut microbiota in pregnancy influences metabolism.	53rd Annual Meeting of the French Society for Immunology.	2021年12月
島村徹平	Deep learning to decipher cell dynamics and cell-cell interactions	第44回日本分子生物学会年会	2021年12月
岡田康志	生命科学研究のDX	JST-BDR共済シンポジウム「バイオDXの最前線」	2021年11月
川上英良	AIを用いた医学研究・医療の未来	第31回日本シミュレーション外科学会	2021年11月
神谷亘	コロナウイルスの非構造蛋白質による複製制御	第68回日本ウイルス学会学術集会　シンポジウム3「SARS-CoV-2（新型コロナウイルス）」	2021年11月
島村徹平	一細胞マルチモーダル情報をデータとモデルから読み解く	産業技術研究所人工知能研究センター第51回AIセミナー	2021年11月
神谷亘	コロナウイルスの増殖と病気について	第17回霊長類医科学フォーラム「市民公開講座」	2021年11月
岡田峰陽	痒みの一次感覚神経の活性化メカニズム	第30回国際痒みシンポジウム	2021年11月
神谷亘	COVID-19を読み解く	群馬医療福祉大学「公開講座」	2021年11月
島村徹平	細胞間コミュニケーションを読み解く深層学習	第94回日本生化学会大会	2021年11月
岩見真吾	SARS-CoV-2の感染・病態におけるウイルス―宿主間相互作用, ドラッグリポジショニングによる抗SARS-CoV-2阻害薬探索のDX:NFVの発見から医師主導治験まで	日本生化学会	2021年11月
長谷耕二	腸管免疫系における絶食応答	第94回日本生化学会	2021年11月
安友康二	Heterogeneity and maintenance of intestinal intraepithelial TCRαβ+CD8αα+ T cells	FIMSA2021	2021年11月
神谷亘	SARSとMERSがもたらしたウイルス学的な問題と対策	千里ライフサイエンスセミナー	2021年11月
松浦　善治	Host factors involved in the propagation and pathogenesis of HCV	第68回日本ウイルス学会	2021年11月
岡田　康志	細胞や分子を見て、判るためのイメージング	日本光学会年次学術講演会基調講演	2021年10月
川上英良	数理科学と医学の融合による精密医療に向けた疾患予測モデルの開発	科学技術政策懇談会	2021年10月
長谷耕二	妊娠中の食物繊維摂取と腸内細菌叢変化が出生児の糖代謝に与える影響	日本人類遺伝学会第66回大会第28回日本遺伝子診療学会大会合同開催	2021年10月
川上英良	AIを用いたデータ駆動型医科学研究	医療・創薬データサイエンスコンソーシアム第2回MD-DSC研究会	2021年10月
長谷耕二	腸内共生と免疫	第28回日本血液代替学会	2021年10月
岡田　康志	手と目と頭の自動化とバイオDX	JST未来社会創造事業ロボティックバイオロジーによる生命科学の加速キックオフシンポジウム	2021年10月
松浦　善治	Molecular Virology as The Basis of Vaccine and Drug Discovery	Focus Group Discussion Series LPPM Vol 4	2021年10月
松浦　善治	Challenges and opportunities in the development of Covid-19 vaccine	The International Conference on Bioscience and Biorefinery 2021	2021年10月
松浦　善治	ウイルス感染症の克服に向けて～新型コロナウイルスの性状と制御法開発～	CSJ化学フェスタ	2021年10月
島村徹平	Modeling cell population dynamics and cell-to-cell communication from single-cell multi-omics data	第80回日本癌学会学術総会	2021年10月
岩見真吾	バイオインフォマティクスを活用したウイルス研究最前線, ウイルス感染の定量的データ解析	第10回生命医薬情報学連合大会	2021年9月
岩見真吾	デジタルツイン時代の創薬研究	日本たばこ産業特別講演	2021年9月
岡田　康志	エピゲノム状態・転写・代謝など細胞状態を可視化する蛍光プローブ技術	ARO協議会第8回学術集会	2021年9月
岩見真吾	脳免疫および精神疾患動態のモデリングとデータ解析について	特別講演	2021年9月
岩見真吾	Mathematical Model-Based Prediction and Application	3rd prediction science seminar	2021年9月
竹内　理	Antiviral innate immunity targeting RNA	European Congress Immunology (ECI) 2021	2021年9月
安田二朗	COVID-19治療薬開発と動物モデル	COVID-19 Special Symposium本邦における感染症研究の今後を考える	2021年8月
島村徹平	データとモデルが駆動する生命科学	第32回高遠・分子細胞生物学シンポジウム	2021年8月
中島裕史	アレルギー疾患の症候・検査所見と疾患:好酸球増多に遭遇した時の診断アプローチ	第15回相模原臨床アレルギーセミナー	2021年8月
岡田峰陽	IL-31刺激を受けた感覚神経による痒み誘導と炎症制御	京都大学皮膚科学セミナー	2021年7月
中島裕史	アレルギー疾患	日本臨床免疫学会免疫疾患横断セミナーシリーズ Human Immunology Priming Seminar	2021年7月
岡田峰陽	痒みの一次感覚神経の活性化機構	第2回アトピー性皮膚炎痒みコンセンサス会議	2021年7月
岡田　康志	超解像蛍光顕微鏡の現状と課題	学振第125委員会講演会	2021年7月
川上英良	医科学研究におけるデータサイエンスと機械学習	東京医科大学講演	2021年7月
岩見真吾	疾患医科学研究におけるAI研究の最前線, 骨代謝マーカーを用いた骨量変動予測の実現に向けて	第39回内分泌代謝学サマーセミナー	2021年7月
川上英良	慢性疾患のデータ駆動型モデリング	第39回日本内分泌学会内分泌代謝学サマーセミナー	2021年7月
岩見真吾	Quantitative Population Dynamics in Interdisciplinary Biology	iTHEMS Colloquium	2021年7月
島村徹平	シングルセルオミクス解析のためのAI技術の最新動向	第39回内分泌代謝学サマーセミナー	2021年7月
川上英良	⼈⼯知能（AI）と慢性疾患研究への応⽤	Digital Health研究会	2021年7月
長谷耕二	Maternal microbiota during pregnancy facilitates metabolic programing of offspring	International DOHaD Society	2021年7月
安友康二	家族性肺線維症のゲノム解析から紐解く肺線維化の分子メカニズム	第48回日本毒性学会学術年会	2021年7月
森石恆司	B型およびC型肝炎ウイルス共感染培養細胞系の開発	微研アドバンスド・セミナー	2021年7月
川上英良	AI・データサイエンスで拓く次世代の医療	第23回日本医療マネジメント学会学術総会　シンポジウム（オンデマンド配信）10. IoT・ビッグデータ・AI時代の医療と介護	2021年7月
岡田峰陽	アトピー性皮膚炎モデルにおけるIL-31による痒み誘導のメカニズム	第6回骨免疫学会	2021年7月
長谷耕二	Symbiotic polyamine metabolism maintains gut immune homeostasis by regulating macrophage differentiation	The 27th International Symposium on Molecular Cell Biology of Macrophages (MMCB2020+1)	2021年6月
竹内　理	Post-transcriptional regulation of innate immunity by Regnase-1	The 27th International Symposium on Molecular Cell Biology of Macrophages	2021年6月
長谷耕二	腸内代謝物による免疫・バリア修飾作用	第25回腸内細菌学会学術集会	2021年6月
川上英良	人工知能（AI）と予防医学への応用	第94回日本産業衛生学会　特別講演 3	2021年5月
安田二朗	COVID-19研究に有用な小動物モデル	第68回日本実験動物学会総会	2021年5月
長谷耕二	腸内代謝物による免疫制御	第95回日本感染症学会	2021年5月
岡田峰陽	バリア組織の感覚神経と免疫	千里ライフサイエンスセミナー	2021年4月

受賞

受賞者	受賞名	受賞年月日
住谷　瑛理子	第50回日本免疫学会学術集会ベストプレゼンテーション賞	2021年12月
安田　圭子	若手女性研究者研究支援事業	2021年12月
安友康二	川野小児医学奨学財団小児医学川野賞	2021年1月

総説・図書

掲載誌名（書籍名）	タイトル	著者名	発行年月
RNA Damage and Repair	The Role of Ribonucleases in RNA Damage, Inactivation and Degradation	Fabian Hia, Osamu Takeuchi	2021年
数理科学	疾患の数理モデリングと定量的データ解析	岩波翔也、チョンヨンダム、キムクァンス、江島啓介、岩見真吾	2021年
実験医学	外来RNAの分解とその制御機構	安田圭子、竹内理	2022年3月
医歯薬出版株式会社	レオウイルスを創る～リバースジェネティクス系によるレオウイルス科の研究～	金井祐太、納田遼太郎、小林　剛	2022年2月
株式会社技術情報協会	第５節　ロタウイルスの増殖機構と病態発現機序	金井　祐太、納田　遼太郎、山﨑　萌子、小林　剛	2021年8月
ASHBi, Kyoto University	Reducing COVID-19 isolation times	岩見　真吾	2021年7月
これだけでわかる!医療AI	ディープラーニングの基礎	川上英良、大矢めぐみ (井川房夫,藤田広志編著)	2021年4月
医学のあゆみ	感染症の一細胞解析	鹿島幸恵、鈴木穣、川名愛	2021年3月
Front Immunol.	Dietary intervention impacts immune cell functions and dynamics by inducing metabolic rewiring	Okawa T, Nagai M, Hase K	2021年2月

研究成果Achievements

2021年度

論文発表

招待講演

受賞

総説・図書